草莓的茎分新茎、根状茎和匍匐茎三种。
1、草莓新茎
草莓植株生长的中心轴为短缩茎。即当年萌发的短缩茎叫新茎。其部位呈弓背形，花序均抽生在弓背的方向。新茎是草莓发叶、生根、长茎、形成花序的重要器官。
草莓新茎上轮生着具有叶柄的叶片，叶腋处有腋芽。腋芽具有早熟性，温度高时萌发成匍匐茎，温度较低时萌发成新茎分枝，有的不萌发成为隐芽。当地上部分受损伤时，隐芽萌发成新茎分枝或匍匐茎。新茎的顶芽到秋季可形成混合花芽，成为主茎上的第一花序。
新茎上着生多数个叶片，基部可发生无数个不定根，新茎分枝的多少在品种间差别很大。
2、草莓根状茎
草莓植株多年生转为木质化了的短缩茎叫根状茎。在第2年，当新茎上的叶片全部枯死脱落后，变成形似根的根状茎，它是一种具有节和轮的地下茎，是贮藏营养物质的器官。2年生的根状茎，常在新茎基部发生大量不定根。3年以上的根状茎分生组织不发达，极少发生不定根，并从下部逐渐衰亡。从外观形态上看，先变褐色，再转变为黑色，其根系随即死亡。因此根状茎越老，其地上部及根系生长越差。
3、草莓匍匐茎
草莓的匍匐茎是由新茎的腋芽萌发形成的特殊的地上茎，茎细，节间长，且具有繁殖能力。
草莓的匍匐茎一般在坐果后期开始抽生，在花序下部的新茎叶腋处先产生叶片，然后出现第一个匍匐茎，开始向上生长，长到叶片高度时，逐渐由株丛少而光照充足的地方，沿着地面匍匐生长。
多数品种的匍匐茎，首先在第二节处向上发出新叶，向下形成不定根。如果土壤湿润，不定根向下扎入土中后，即长成一株匍匐茎苗。一般2～3周子苗即可成活，随后在第四、第六、第八等偶数节上发出匍匐茎苗。
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