冲绳的主权未定，但冲绳的最终主权归属应由中国和冲绳人自己来决定。目前，日本对冲绳只有管辖权。
冲绳的本名叫琉球，明清时期一直都是中国的藩属国，作为日本对外扩张的目标之一，琉球首当其冲，逐步沦为日本的附庸。1879年日本正式吞并琉球王国，并改名为冲绳，在此设冲绳县。
第二次世界大战结束后，作为战败国的日本，根据《波茨坦公告》第8条的补充规定重新划定了日本主权领土之范围：“开罗宣言之条件必将实施，而日本之主权必将限于本州、北海道、九州、四国及吾人所决定其他小岛之内。”这其中的其他小岛并没有明确包含冲绳列岛，冲绳列岛暂时由美军代管。
作为战略地位非常重要的冲绳，美国正是凭借着巨大的人员伤亡攻下冲绳后，实现对日本本土的空中打击，也因此彻底扭转了太平洋战局。因此美国在战后并不想放弃对冲绳的占领，从1945年到1972年期间一直都由美军直接管辖冲绳，直到1972年美军才将冲绳交还于日本，不过，美军仍然在冲绳设立有不少军事基地，以维持其在东亚的军事存在。
1951年日本和美国签订的《美日旧金山和约》中规定日本虽拥有琉球的主权，但行政权归属美国。但是这一份合约是日美之间的私相授受，没有公信力，也因此并没有得到国际社会的承认，这也为未来冲绳（琉球）的主权归属问题埋下了伏笔。
冲绳主权待定，那么谁才能拥有冲绳主权呢？
由于冲绳是在1872年被日本强行占有的，属于侵略领土，按照《波茨坦公告》的规定，日本必须放弃所得侵略土地，这也就意味在二战结束后日本已经失去了对冲绳的主权，只不过由于日美之间的暗箱操作，才使得日本始终占有冲绳，牢牢掌握着对冲绳的管辖权。
冲绳的主权，一方面应由冲绳人自己来决定，作为中国历史上明清两朝的重要藩属国，中国至今都没有承认日本对冲绳之主权，二战结束后冲绳人也一直致力于“琉球复国运动”，试图脱离日本的统治，成立一个拥有独立主权的琉球国。
另一方面，作为宗主国的中国，比作为侵略者的日本更有资格拥有对冲绳的主权，要知道中国对琉球（冲绳）的藩属关系整整持续了五个世纪，琉球王国是一个独立国家，但长期臣属于中国，从历史渊源来看，中国比任何国家都有资格拥有对琉球（冲绳）行使主权。
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