继TCGA后,中文版GEO数据库也终于来了!
众所周知,TCGA和GEO是最著名的两大公共数据库。TCGA是美国国家癌症研究所(National Cancer Institute)和美国人类基因组研究所(National Human Genome Research Institute)共同监督的一个项目,旨在应用高通量的基因组分析技术,以帮助人们对癌症有个更好的认知,从而提高对于癌症的预防、诊断和治疗能力。
而GEO数据库全称GENE EXPRESSION OMNIBUS,是由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库。它创建于2000年,收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据,也就是说只要是目前已经发表的论文,论文中涉及到的基因表达检测的数据都可以通过这个数据库中找到。
日前据媒体报道,为“生信分析0代码”而生的临床生信之家,继解决TCGA数据后,1月29日今天上午,终于开始录入GEO数据了,这预示中文版GEO数据库的到来!
从体验看,其有以下特点:
1.所有数据都来之GEO,以上提到的难弄的数据预处理过程均自动完成。
2.临床生信之家一贯的:无需代码基础,鼠标点点点即可完成ID转换,数据标准化,去批次,高清出图,原始数据下载一气呵成!
3.数据集介绍全部实行中英文对照。
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