纳米空间内的染色质组成,也就是染色质纳米环境,在细胞生命过程中扮演了重要角色。然而,当前缺乏有效的识别检测方法,无法探究染色质纳米环境,以理解染色质复杂组成、构象及调控机制。
西安交通大学生命学院生命分析化学与仪器研究所赵永席教授团队利用新方法,实现了单细胞内一种组蛋白PTM周围多种DNA表观修饰的成像分析。
该方法以“一对多”染色质纳米环境为分析对象,提出DNA邻近循环识别机理,发展DNA步移索引扩增检测方法,可检出目标PTM位点约10nm半径空间内各种DNA修饰的位点数目与亚细胞分布,即“一对多”染色质纳米环境。
通过探测多种组蛋白PTM的纳米环境,揭示细胞周期过程中染色质纳米环境的动态变化,实现了临床肺癌患者细胞样品中染色质纳米环境的分析检测。
该研究为探究染色质纳米环境的复杂组成、生物功能及调控机制奠定了检测方法学基础。通过调控DNA探针的长度,可探测5nm到30nm半径范围的纳米环境。此外,该方法具有很好的通用性,改变分子识别方式,还能拓展用于转录因子、膜蛋白等其他生物大分子的纳米环境分析。
该研究工作以《胞内大分子锚定的DNA步移索引技术用于染色质修饰纳米环境的探究》(Cellular macromolecules-tethered DNA walking indexing to explore nanoenvironments of chromatin modifications)为题在国际权威期刊《自然-通讯》(Nature Communications)上在线发表。
西安交通大学生物医学信息工程教育部重点实验室生命分析化学与仪器研究所为该论文的第一作者单位和通讯作者单位,陈锋副教授与白敏博士为第一作者,赵永席教授为唯一通讯作者。
该研究得到国家自然科学基金、陕西省自然科学基金、中国博士后科学基金、西安交大青年拔尖人才支持计划等项目的共同资助,实验测试得到西安交大分析测试共享中心的大力支持。
前瞻经济学人APP资讯组
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