来源 | JGG
蓝藻是一类能进行光合作用的革兰氏阴性细菌,在生产清洁能源和再生生物燃料等生物技术应用中具有巨大潜力。集胞藻有3000多个基因,所编码蛋白质的亚细胞定位很大程度上决定了其所行使的功能。因此,建立集胞藻蛋白质组亚细胞定位图谱对于光合作用理论研究与基于蓝藻的生物技术研究都具有重要意义。
2021年11月11日,中国科学院遗传与发育生物学研究所汪迎春研究员团队和中国科学院植物研究所黄芳研究员团队合作在Journal of Genetics and Genomics在线发表题为“The Quantitative Proteome Atlas of a Model Cyanobacterium”的研究论文,报道了一种模式蓝藻集胞藻蛋白质组亚细胞定位精细图谱。
该研究从集胞藻Synechocystis sp. PCC6803中分离纯化外膜、质膜、类囊体膜、细胞质和周质空间等亚细胞组分,并使用无标记定量蛋白质组学技术明确了超过2000种蛋白质在这些亚细胞组分中的分布模式,以此绘制集胞藻蛋白质组亚细胞定位的精细图谱。该图谱可以通过一个用户友好界面的数据库进行检索并实现可视化(https://cyanoatlas.sourceforge.io/)。该报道首次为集胞藻60%以上的蛋白质提供全面和精确的亚细胞定位信息,是蓝藻研究领域的重要数据资源。
集胞藻蛋白质组亚细胞定位精细图谱绘制
中国科学院遗传与发育生物学研究所王金龙博士、黄夏禾工程师和葛海涛博士为该论文共同第一作者,汪迎春研究员和黄芳研究员为共同通讯作者。相关工作得到国家自然科学基金的资助。
论文链接:
https://doi.org/10.1016/j.jgg.2021.09.007
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