变形菌门—γ-变形菌纲（上）
细菌域
细菌界
变形菌门
γ-变形菌纲
γ‐变形菌纲（学名：Gammaproteobacteria）属于细菌界变形菌门，是目前所知的细菌中种类最多的一纲，包括一些医学上和科学研究中很重要的类群，如肠杆菌科（Enterobacteraceae）、弧菌科（Vibrionaceae）和假单胞菌科（Pseudomonadaceae）。很多重要的病原菌属于这个纲，如沙门氏菌属（Salmonella）（肠炎和伤寒）、耶尔辛氏菌属（Yersinia）（鼠疫）、弧菌属（Vibrio）（霍乱）、绿脓杆菌（Pseudomonas aeruginosa）（就医时引发的肺部感染或者囊性纤维化）。重要的模式生物大肠杆菌也属于此纲。
1.下属目
着色菌目（Chromatiales）
酸硫杆菌目（Acidithiobacillales）
黄单胞菌目（Xanthomonadales）
心杆菌目（Cardiobacteriales）
硫发菌目（Thiotrichales）
军团菌目（Legionellales）
甲基球菌目（Methylococcales）
海洋螺菌目（Oceanospirillales）
假单胞菌目（Pseudomonadales）
交替单胞菌目（Alteromonadales）
弧菌目（Vibrionales）
气单胞菌目（Aeromonadales）
肠杆菌目（Enterobacteriales）
巴斯德氏菌目（Pasteurellales）
咸水球形菌目（Salinisphaerales）
2.酸硫杆菌目
酸硫杆菌目（学名：Acidithiobacillales）为γ‐变形菌纲的一个目。此目的模式属为酸硫杆菌属(Acidithiobacillus)。
下属科：
酸硫杆状菌科（Acidithiobacillaceae）
热硫杆状菌科（Thermithiobacillaceae）
（1）酸硫杆状菌科
酸硫杆状菌科（学名：Acidithiobacillaceae）为酸硫杆状菌目的一科细菌。此科的模式属为酸硫杆状菌属(Acidithiobacillus)。
酸硫杆状菌是酸硫杆状菌属的微生物，原产地为中国。革兰氏阴性多细胞丝状细菌,在缺乏化合态氮源的情况下，会有5－10％的细胞分化出异形胞，异形胞可以固氮。在显微镜下观察，异形胞的荧光要比营养细胞的弱很多，异形胞较营养细胞大。
（2）热硫杆状菌科
热硫杆状菌科（学名：Thermithiobacillaceae）为酸硫杆状菌目的一科细菌。此科的模式属为热硫杆状菌属(Thermithiobacillus)。
3.黄单胞菌目（1）下属科
华杆菌科（Sinobacteraceae）
黄单胞菌科（Xanthomonadaceae）
（2）黄单胞菌科
黄单胞菌科（学名：Xanthomonadaceae）为黄单胞菌目的一个科。此科的模式属为黄单胞菌属(Xanthomonas)。现为溶杆菌科（Lysobacteraceae）的异名。
黄色单胞菌属（学名：Flavimonas）为假单胞菌目假单胞菌科的一属好氧或兼性厌氧发酵型革兰氏阴性杆菌。直杆菌，端圆。在通常的环境中可以检出。为人类及其他温血运动物腐生菌或共生菌，偶尔致病。
是G-、专性好氧、化能有机营养型的植物病原细菌。细胞直杆状，大小0.4～0.7 μm x 0.7～1.8 μm，单端极生鞭毛。多数菌株分泌不溶于水的非类胡萝卜素性质的黄色素，有些菌株形成胞外荚膜多糖——黄原胶。生长需提供谷氨酸和甲硫氨酸。在野油菜黄单胞菌的致病菌株中，葡萄糖代谢主要通过ED途径，小部分通过HMP途径，还存在TCA循环和乙醛酸循环。本属菌种产生的降解性酶包括羧甲基纤维素酶、甘露聚糖酶、果胶酶(包括果胶酸内裂解酶、果胶甲酯酶)和木聚糖酶。不进行硝酸盐呼吸。某些生长缓慢的菌株要培养1周以上才能形成菌落。菌落圆形、光滑、全缘、乳脂状。最适生长温度为25～30℃。0.1%T犹可抑制其生长。过氧化氢酶阳性，氧化酶阴性或弱阳性。G+ C mo1%值为63～71。已知种有24个(2000年)。模式种为野油菜黄单胞菌，它是葡萄藤枯萎病和溃疡病的病原菌。
当生长在5%葡萄糖营养琼脂平板上时无黏性。耐1%NaCl。脲酶阳性。不产黄单胞菌黄素。在酵母膏、半乳糖、碳酸氢钙琼脂上形成褐色水溶性色素。是重要工业原料黄原胶的生产菌。野油菜黄单胞菌ATCC 33913菌株的基因组大小为5.07Mb(2002)地毯草黄单胞菌306菌株的基因组大小为5.17Mb(2002)。
此属的模式种为栖稻黄色单胞菌(Flavimonasoryzihabitans)。
4.心杆菌目
下属科：心杆菌科（学名：Actinobacillus）
心杆菌科（学名：Actinobacillus）为心杆菌目的一科细菌。此科的模式属为心杆菌属(Cardiobacterium)。
1990年，Dewhirst等人通过对产吲哚金氏菌(Kingellaindologenes)、人心杆菌 (Cardiobacterium hominis)及节瘤拟杆菌(Bacteroidesnodosus)的16SrRNA序列分析结果，提出建立了心杆菌科这个新菌科。
（1）心杆菌属
心杆菌属（学名：Cardiobacterium）为心杆菌科的一个属。该属的模式种为人心杆菌（Cardiobacterium hominis）。
（2）萨顿氏菌属
萨顿氏菌属（学名：Suttonella）为心杆菌目心杆菌科的一属好氧或兼性厌氧发酵型革兰氏阴性杆菌。因为萨顿（Sutton）首先描述该菌种的特征，故使用他的名字命名该属细菌。
此属的模式种为产吲哚萨顿菌(Suttonellaindologenes)。
5.甲基球菌目
甲基球菌目（学名：Methylococcales）为γ-变形菌纲的一目细菌。此目的模式属为甲基球菌属(Methylococcus )。
下属科：
甲基球菌科（Methylococcaceae）
甲基热菌科（Methylothermaceae）
（1）甲基球菌科
甲基球菌科（学名：Methylococcaceae）为甲基球菌目的一科细菌。此科的模式属为甲基球菌属(Methylococcus)。
①甲基球菌属
甲基球菌属（学名：Methylococcus）为甲基球菌目甲基球菌科的一属好氧或兼性厌氧发酵型革兰氏阴性杆菌。细胞球状，通常成对出现。此属的模式种为荚膜甲基球菌(Methylococcus capsulatus)。
②甲基单胞菌属
甲基单胞菌属（学名：Methylomonas）为甲基球菌目甲基球菌科的一属好氧或兼性厌氧发酵型革兰氏阴性杆菌。直、弯或分枝的杆菌。此属的模式种为甲烷甲基单胞菌(Methylomonas methanica)。
（2）甲基热菌科
甲基热菌科（学名：Methylothermaceae）为甲基球菌目的一科细菌。此科的模式属为甲基热菌属(Methylothermus )。
6.海洋螺菌目
海洋螺菌目（Oceanospirillales）是变形菌门（Proteobacteria）下的一个目，包含两个科。 海洋螺菌常为食骨蠕虫（Osedax）的内共生体。海洋螺菌虽然不会出现在食骨蠕虫的卵母细胞中，但会被这些细胞在发育后不久获得。
下属科：
食碱菌科（Alcanivoraceae）
河氏菌科（(Hahellaceae）
盐单胞菌科（(Halomonadaceae）
岸生菌科（Litoricolaceae）
海洋螺菌科（Oceanospirillaceae）
嗜油菌科（Oleiphilaceae）
糖螺菌科（Saccharospirillaceae）
（1）食碱菌科（烷烃降解菌科）
食碱菌科（烷烃降解菌科，学名：Alcanivoracaceae）为海洋螺菌目的一科细菌。此科的模式属为烷烃降解菌属(Alcanivorax)。
烷烃降解菌属（食烷菌属，学名：Alcanivorax）为烷烃降解菌科的一属细菌。该属的模式种为泊库岛食烷菌（Alcanivorax borkumensis）。
（2）河氏菌科
河氏菌科（学名：Hahellaceae）为海洋螺菌目的一科细菌。此科的模式属为河氏菌属(Hahella)。
（3）盐单胞菌科
盐单胞菌科（学名：Halomonadaceae）为海洋螺菌目的一科细菌。此科的模式属为嗜盐单胞菌属(Halomonas)。
①德莱氏菌属
德莱氏菌属（学名：Deleya）为海洋螺菌目盐单胞菌科的一属好氧或兼性厌氧发酵型革兰氏阴性杆菌。直杆状菌。发现于海洋环境中，其中有一个种（嗜盐德莱氏菌Deleya halphila)发现于高盐的土壤中。此属的模式种为海水德莱氏菌(Deleya aesta)。
②嗜盐单胞菌属
嗜盐单胞菌属（学名：Halomonas）为盐单胞菌科的一属真菌。该属的模式种为高嗜盐菌（Halomonas elongata）。
菌落形态为圆形，乳白色，凸透镜状，边缘完整，菌落直径较大，革兰氏染色负反应杆菌，需NaCl才能生长，最适NaCl浓度为3%，产淀粉酶，过氧化氢酶，不能水解明胶，硝酸盐还原阳性，不能发酵果糖、葡萄糖、甘露糖、半乳糖、乳糖、麦芽糖、蔗糖产酸。
（4）岸生菌科
岸生菌科（学名：Litoricolaceae）为海洋螺菌目的一科细菌。此科的模式属为岸生菌属(Litoricola)。
（5）海洋螺菌科
海洋螺菌科（学名：Oceanospirillaceae）为海洋螺菌目的一科细菌。此科的模式属为海洋螺菌属(Oceanospirillum)。
①海单胞菌属
海单胞菌属（学名：Marinomonas）为海洋螺菌目海洋螺菌科的一属好氧或兼性厌氧发酵型革兰氏阴性杆菌。此属的模式种为普遍海单胞菌(Marinomonas communis)。
②海洋螺菌属
海洋螺菌属（学名：Oceanospirillum）为海洋螺菌目海洋螺菌科的一属细菌。此属的模式种为线形海洋螺菌(Oceanospirillum linum)。
（6）嗜油菌科
嗜油菌科（学名：Oleiphilaceae）为海洋螺菌目的一科细菌。此科的模式属为嗜油菌属(Oleiphilus)。
（7）糖螺菌科
糖螺菌科（学名：Saccharospirillaceae）为海洋螺菌目的一科细菌。此科的模式属为糖螺菌属(Saccharospirillum)。
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