情景重现
有老师咨询IC50用什么软件计算比较准确,本期我们就采用3种方法计算IC50,看看差异大不大。分别采用Excel、SPSS和Graphpad prism来预测计算。
3种方式比较分析
1.Excel:
输入到Excel里,然后作图用散点图:
然后点击鼠标右键添加趋势线(判断用对数拟合):
拟合曲线和公式如下:
随机输了拟合还不错,R接近1。然后根据公式,反对数计算出抑制率y在50%时的浓度x值,约为88.32mg/mL。
2. SPSS:
我们先输入数据:包括浓度、抑制率和总数(注意总数就写100,不然不能计算)。
然后分析-回归-Probit,如下:
按照红框选入变量:
运算结果显示:IC50~93.448 Cl [79.826,110.551]
3.prism:
选择上述X-Y单独对应:
在点击分析,transfer,如下图选择:
然后点击OK获得转换后的数据,我们再点击分析,选择非线性拟合:
点击OK,然后点击Constrain,分别设置bottom和Top值为0~100。
最终结果为IC50 [80.69-111.5]
【总结】
Excel:88.32mg/mL,没有置信区间,不知道Excel能不能算。
SPSS:IC50~93.448 Cl [79.826,110.551]
Prism:IC50 [80.69-111.5]
今天就分享到这了,可见三种方式,IC50结果相近,那大家自己选择吧~
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