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细胞半数抑制率IC50的计算与比较,Excel、SPSS和prism哪种方法好用?

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情景重现

有老师咨询IC50用什么软件计算比较准确,本期我们就采用3种方法计算IC50,看看差异大不大。分别采用Excel、SPSS和Graphpad prism来预测计算。

3种方式比较分析

1.Excel

输入到Excel里,然后作图用散点图:

然后点击鼠标右键添加趋势线(判断用对数拟合):

拟合曲线和公式如下:

随机输了拟合还不错,R接近1。然后根据公式,反对数计算出抑制率y在50%时的浓度x值,约为88.32mg/mL

2. SPSS

我们先输入数据:包括浓度、抑制率和总数(注意总数就写100,不然不能计算)。

然后分析-回归-Probit,如下:

按照红框选入变量:

运算结果显示:IC50~93.448 Cl [79.826,110.551]

3.prism

选择上述X-Y单独对应:

在点击分析,transfer,如下图选择:

然后点击OK获得转换后的数据,我们再点击分析,选择非线性拟合:

点击OK,然后点击Constrain,分别设置bottom和Top值为0~100。

最终结果为IC50 [80.69-111.5]

【总结】

Excel:88.32mg/mL,没有置信区间,不知道Excel能不能算。

SPSS:IC50~93.448 Cl [79.826,110.551]

Prism:IC50 [80.69-111.5]

今天就分享到这了,可见三种方式,IC50结果相近,那大家自己选择吧~

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