日本位于欧亚和太平洋的交界地带，是个岛屿图家，狭长而多山，其四分之三为山体所覆盖，海岸线曲折，约为30000多公里。
本州中部地区被称为“日本屋脊”，许多山脉的海拔超过3000米。位于东京附近，山梨县和静冈县的交界处的富士山，海拔3776米，是日本海拔最高的山。
日本四大岛分别是北海道、本州、四国、九州。本州岛是日本最大的一个岛屿，位于日本列岛的中部。
冲绳海槽，海槽属于生长边界，有可能最终产生新的海洋。冲绳海槽最大深度超过2700米，部分已呈现出洋底的特点。
日本海并非是“日本的海”，而是公海，是西北太平洋最大的边缘海，北起为库页岛、东临北海道、本州和九州，西临俄罗斯和中国东北，南临朝鲜半岛。
在日本东部有4条极深的海沟，马里亚纳海沟深达11公里，日本和冲绳海沟也有10公里，都是板块俯冲的产物。
众多板块的相互挤压，使日本象楔子一样从水中升起，并将使日本未来越抬越高。如果海水继续东退，未来这里或许会形成高原，就象青藏高原和喜马拉雅山脉一样，形成原因一致，时间先后。
日本海具有弧后拉张盆地的性质，这种弧后盆地会造成岩石圈的拉张断陷，从而形成洋壳和深水洋盆。
日本列岛地震和火山频发，处于环太平洋地震带。
弧后盆地主要分布于西太平洋边缘，包括白令海，鄂霍次克海，日本海，冲绳海槽，菲律宾海，南海，苏禄海，拉威西海和班达海。
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