受PROTAC启发，降解抑制性蛋白，增强CAR-T细胞疗法

本文来自微信公众号：生物世界（ID：ibioworld），作者：王聪

过去十年里，以 CAR-T 为代表的细胞疗法改变了肿瘤治疗领域的格局，尤其是在血液类肿瘤中展现出传统疗法无可比拟的治疗效果，为患者带来了新的希望。为了提高细胞治疗效果，研究人员通过 CRISPR-Cas9 筛选识别限制 T 细胞抗肿瘤效力的基因，目前已有多项 CRISPR 基因编辑修饰的 T 细胞疗法进入临床试验，

然而，许多限制 T 细胞抗肿瘤效力的基因在实际应用中仍然具有挑战性。首先，与血液系统恶性肿瘤相关的基因（例如 TET2 和 DNMT3A）不可逆敲除可能会增加工程细胞转化的风险。其次，限制免疫细胞功能的核心通路通常在遗传上是冗余的，因此很难在不诱导多次基因组编辑和 DNA 双链断裂的情况下进行靶向。第三，负向调控基因通常也发挥着预防过度刺激的有益作用。

因此，需要创新技术来对限制细胞免疫疗法的蛋白质进行条件性、多特异性调控，而不必靶向与癌症相关的基因位点。

2023 年 11 月 20 日，哈佛医学院的研究人员在 Cell 子刊 Cell Chemical Biology 上发表了题为：Genetic retargeting of E3 ligases to enhance CAR T cell therapy 的研究论文。

该研究借鉴了蛋白靶向降解嵌合体（PROTAC），开发了双功能融合“降解”蛋白，连接一个或多个目标蛋白和 E3 连接酶复合物，以加强目标蛋白泛素化和降解。通过诱导降解转基因表达或小分子依赖的 E3 招募，开发了条件性降解策略。并使用该策略来靶向降解转录因子 SMAD2/SMAD3，从而阻断 SMAD 依赖的 TGFβ 信号，SMAD 降解的 CAR-T 细胞表现出增强的体内抗肿瘤效力。

这项表明，这是一个临床上适用的合成生物学平台，可以重编程 E3 连接酶的目标特异性，用于条件性、多特异性内源性蛋白降解，具有包括增强 CAR-T 细胞疗法效力在内的有前途的应用。

CAR-T 细胞疗法是癌症治疗的新突破。然而，治疗失败往往是由 CAR-T 细胞功能障碍引起的，需要更多的方法来克服限制免疫细胞抗肿瘤效力的抑制信号。

除了在 DNA/RNA 水平敲除或干扰这些抑制免疫细胞抗肿瘤效力的基因外，可诱导的蛋白-蛋白相互作用控制内源性蛋白质丰度是重连细胞电路和靶向抑制细胞免疫疗法通路的另一种方法。事实上，第一个蛋白靶向降解嵌合体（PROTAC）部分是基于肽的双功能分子，桥接 E3 泛素连接酶和靶蛋白，从而诱导靶蛋白泛素化和降解。这种诱导靶蛋白降解的 E3 招募策略已被用于诱导模型系统中 GFP 标记的融合蛋白的降解，以及在人细胞中靶向内源性蛋白质，例如 β-catenin 白和 PCNA。虽然这种双功能融合蛋白正在成为经过验证的实验工具，但还没有被用于基因和细胞疗法。

在这项研究中，研究团队报告了全人源序列 E3 招募融合蛋白的开发，称为合成底物受体（SySR），以诱导限制 CAR-T 细胞效力的蛋白组的条件性、多特异性降解。研究团队优化了多种广泛表达的 E3 连接酶的结合域，使多种细胞类型的有效靶标降解率>90%。

对于合成电路应用，该研究探索了两种策略，即通过诱导启动子和来那度胺诱导的靶向 CRL4CRBN 的条件性靶向降解。为了证明细胞治疗应用的概念，研究团队开发了靶向多个 SMAD 家族转录因子的 SySR，这些转录因子加强了 T 细胞抑制性 TGF-β 信号。结果显示，对 SMAD 的降解增强了 CAR-T 细胞的增殖和抗肿瘤功能。

这些结果表明，合成底物受体（SySR）是一个可推广和临床上适用的平台，用于降解免疫细胞的抑制性蛋白组，从而增强下一代细胞免疫疗法。

论文链接：

1.https://doi.org/10.1016/j.chembiol.2023.10.024

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