轮状病毒(Rotavirus,RVA)是导致5岁以下婴幼儿急性胃肠炎的主要病原体之一。本文旨在分析我国一例罕见的G9P[8]-A2基因型重配株RVA(JL18221140)的全基因组分子特征。
方法
研究采用从中国吉林省采集的G9P[8]基因型RVA原始粪便标本,利用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增其11个基因节段,并使用DNAStar和MEGA 11.0等生物信息分析软件进行同源性及系统发育分析。
结果
基因型分析:该病毒的全基因组11个节段基因型为G9-P[8]-I1-R1-C1-M1-A2-N1-T1-E1-H1,其中NSP1基因型呈现DS-1样特征。
系统发育分析:VP7和VP4基因分别聚集在谱系G9-VI和P[8]-Ⅲ中。与其他中国毒株的核苷酸和氨基酸同源性均在99.00%以上。
重配来源:该罕见重配株可能由中国流行的G9P[8]-A1和G2P[4]-A2毒株在共感染过程中基因组重配产生。
JL18221140是一种罕见的G9P[8]-A2重配株,其基因组特性表明对RVA进行持续监测和全基因组测序的重要性。这为理解中国RVA毒株的遗传变异、病毒防控和疫苗研发提供了基础数据。
本研究首次报道了我国G9P[8]-A2基因型重配株的全基因组分子特征,强调了对RVA毒株的全面监测和研究的重要性,为今后病毒防控和疫苗研发提供了关键数据和科学依据。
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