随着测序技术的飞速发展,转录组学在生物表型和基因表达研究中占据重要地位。最近,Nature Reviews 发表综述,全面讨论了转录组技术在样本处理、数据分析和技术应用的最新进展及挑战[1]。转录组是研究必备工具之一,然而如何进行实验分组设置及个性化建库?为保证数据质量和可靠性,如何获取高质量的核酸?海量数据如何深入挖掘分析及后续验证?
为了更好进行转录组研究,天根生物将于 11 月 6 日 15:00 开展《从实验设计、分析到验证,轻松掌握转录组研究》线上课程,从技术流程、实验设计、样本核酸提取、建库到分析验证,一站式全解析。还有针对重难点和常见问题,提供最佳解决方案,全面助力转录组研究。现在报名直播,还有机会获取保温杯、小米背包、U 盘等 50 份惊喜好礼!
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样本核酸提取注意事项:
1)样本保存:
① 新鲜组织样本,生理盐水 or RNase free water 清洗,冰上切割,分装(50~100 mg/块),液氮速冻,-80℃ 保存,干冰运输。
② RNAlater 保存,新鲜组织样本切割成大小介于小米粒到绿豆之间(各面厚度 < 0.5 cm,肿瘤组织 RNase 活性极高,建议切成 2~3 mm),浸泡在 5 倍体积的 RNAlater,充分浸润后,-80℃ 保存,干冰运输。
2)RNA 提取纯化:
① 提取过程中避免剧烈操作以造成核酸降解。
② 充分洗涤,避免盐离子/乙醇残留。
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个性化文库构建:
1)常见的 RNA 文库类型有 mRNA 文库、lncRNA 文库、小 RNA 文库和 circRNA 文库。根据研究目的选择。
2)RNA 文库构建基本流程:RNA 富集、RNA 建库、文库质控和定量。
3)RNA 富集策略及选择
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内容策划:沈佳钰
内容审核:钟可可
题图来源:图虫创意
参考文献:
[1]. Gulati GS, D'Silva JP, Liu Y, Wang L, Newman AM. Profiling cell identity and tissue architecture with single-cell and spatial transcriptomics. Nat Rev Mol Cell Biol. 2024 Aug 21. doi: 10.1038/s41580-024-00768-2.
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