如何正确使用基因/蛋白质的名称格式（大写与斜体的使用）

来源：LetPub 中文官网

1 一般规则

· 在你的文章中使用大家都认可的基因/蛋白质的名称和符号 (见下文)

· 有时认可的基因/蛋白质的名称或符号已经不再有效。这种情况下，第一次提到的基因/蛋白质，需要先列出经批准的名称，然后再添加 括号说明 (以前被称为 XXX)。例如，「我们使用抗 POU5F1 蛋白的抗体 (以前称为 OCT-4)...」。注意使用正确的符号，而不是以往的名称。

2 不同物种有不同的规则

1) 小鼠 / 大鼠 / 鸡

(1) 一般命名规则 (适用于小鼠，大鼠和鸡)：

· 基因的全名不用斜体，也不用希腊字母

例如：insulin-like growth factor 1(胰岛素样生长因子 1)

· 基因符号不用希腊字母和连字符，使用斜体，第一个字母大写，其余小写

例如：Igf1 (斜体)(胰岛素样生长因子 1)

· 蛋白质的名称和基因符号相同，但不用斜体，并全部大写

例如：IGF1

· mRNA 和 cDNA 的基因符号和规定的格式

例如："... levels of Igf1 (italicized) mRNA increased when..."

· 首次提到的突变等位基因应该详细列出

例如：Igf1tm1Arge/Igf1tm1Arge (italicized) is one of several knockout alleles of Igf1 (italicized)

· 所有字母和数字用斜体，等位基因的符号 (tm1Arge) 要用上标

· 经前面详细描述之后，敲除的纯合子可表示为 Igf1-/- (所有字母均用斜体，并且- / -用上标)；杂合子为 Igf1 + / - 等。

(2) 对于这些命名规定的详细信息，请参阅：

· (小鼠，大鼠，鸡) http://www.informatics.jax.org/

· (专门针对大鼠) http://rgd.mcw.edu/

· MGI 命名：http://www.informatics.jax.org/mgihome/nomen/index.shtml

· 基因的 MGI 快速指南：

http://www.informatics.jax.org/mgihome/nomen/short_gene.shtml

2) 人类/非人类灵长类动物/家畜/ 除了小鼠、大鼠、鱼、昆虫、苍蝇外默认的其他物种

· 完整的基因名称不用斜体和希腊字母

例如：insulin-like growth factor 1(胰岛素样生长因子 1)

· 基因符号不使用希腊字母和连字符，基因符号用斜体，所有的字母用大写

例如：IGF1(斜体)

· 蛋白质的名称与基因符号相同，但不用斜体，并全部大写

例如：IGF1

· mRNA 和 cDNA 的基因符号和规定的格式

例如："... levels of IGF1 (italicized) mRNA increased when..."

更多关于此类物种基因 (突变的等位基因) 命名规则和符号的网站：

http://www.genenames.org/

3) 鱼 (适用于所有的鱼)

· 完整的基因名称用斜体表示，全部用小写字母，不要用希腊字母

例如：cyclops(斜体)

· 基因符号用斜体，全部小写

例如：cyc(斜体)

· 蛋白质命名与基因符号相同，但仅首字母大写，也不用斜体

例如：Cyc

更多关于此类物种基因 (突变的等位基因) 命名规则和符号的网站：

http://zfin.org/cgi-bin/webdriver?MIval = aa-ZDB_home.apg

4) 其他有用的网站：

· ExPASy(特殊蛋白质分析系统)：是瑞士生物信息学研究所 (SIB) 提供的蛋白质组学服务系统，可对蛋白质序列和结构以及二维 PAGE 进行分析：(http://au.expasy.org / )

· OMIM -孟德尔人类遗传学数据库：

(www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db = OMIM )

· NCBI - Entrez Gene：提供了一个按序列和/或在 NCBI's Map Viewer 中查询基因的统一环境。您可以查询名称，符号，加入，出版物，GO 条款，染色体数目，EC 号码，和许多其他相关基因及它们的编码产物。(www.ncbi.nlm.nih.gov/gene )

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